以文本方式查看主题 - 肝胆相照乙肝论坛 -- 学术讨论& HBV English ---- HBV基因型研究 (http://www.hbvhbv.info/forum/viewthread.php?tid=543329) |
-- 作者:benben00 -- 发布时间:2006-2-24 16:18:45 -- HBV基因型研究 乙肝病毒基因分型比血清亚型更能准确地反映原型病毒株之间的自然异质性,HBV基因分型方法有多种,以全 1988年Okamoto等L2j发现:血清亚型的区分并不能真正反映HBV基因组的差异,由此规 |
-- 作者:benben00 -- 发布时间:2006-2-24 16:23:08 -- 2 HBV 分型的方法 2.1 HBV的全基因测序
而杨洁等[ 建立的Muhiplex PCR分型方法,在一个PCR反应体系中含有多对引物的PCR。方法简便,准确率高,理论上准确率应为100% 。
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-- 作者:benben00 -- 发布时间:2006-2-24 16:26:15 -- 3 HBV基因型流行病学分布 在我国北方以c型为主,南方以B型为主,D型多见于少数民族地区,如西藏、新疆L】引。A、F型偶有发现,无E型。 目前认为,
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-- 作者:benben00 -- 发布时间:2006-2-24 16:30:20 -- 4.3 HBV基因型别与疾病转归的关系
Tsubota等【 报道26例LC患者中,B型19例中有4例为HCC,C型7例中有5例为HCC。经Logistic回归分析发现,年龄是独立危险因素(但当年龄<45岁时,基因型是独立危险因素),且发现B型HCC对 总之,HBV基因型与临床表现、预后、治疗应答均有一定关系,提示不同基因型具有不同的致病性,在以B、C为优势为地区,C型具有较强的致病能力,预后差。在以A、D为优势的地区,D型具有较强的致病性,肝病严重,预后不良。近年来乙肝基因型与抗病毒药物疗效的研究,提示不同基因型间的药物敏感性也有差异。Kao等还比较了B、C型乙肝患者对干扰素ct-2b的应答反应,结论为年轻、B基因型感染者可能预示对干扰素有较好的应答。wai等126 J也认为B型乙肝病人血清HBeAg对干扰素的应答优于C型。
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-- 作者:希特勒 -- 发布时间:2006-3-12 8:53:52 -- 路过,顶下. |
-- 作者:dsjc001 -- 发布时间:2006-9-23 23:02:24 -- 俺是c型,郁闷 |
-- 作者:张小军 -- 发布时间:2006-10-15 19:02:22 -- 我不知道是什么、 |
-- 作者:xiaozou -- 发布时间:2006-11-3 21:31:38 -- 关于乙肝病毒基因型,本人曾写给一篇综述,在2004年发表。 乙型肝炎病毒基因型与临床关系的研究进展 [摘要] 乙型肝炎病毒基因型的研究是当前国内外乙型肝炎研究的热点,目前分为A-H 8个基因型,乙型肝炎病毒基因型与乙型肝炎的流行病学分布、病毒变异、病毒复制与清除、抗病毒治疗疗效及疾病进展、预后评估均存在一定的相关性。 [关键词]: 肝炎病毒,乙型;基因型;临床 乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)为一双链DNA病毒,属嗜肝DNA病毒。HBV感染是一个全球性的健康问题,目前全球大约有3.5亿HBV慢性感染者,仅中国就有1.2亿HBV携带者。HBV基因组又称HBV DNA,约由3200个碱基对组成。近年来,随着分子生物学技术的迅猛发展和对HBV认识的不断深入,国内外许多学者对HBV基因分型开展了多方面的研究,为此,本文将近年来的研究进展作一综述。 1. HBV基因型的建立和发展 1988年,Okamoto等[1]通过对18株不同血清亚型的HBV DNA全序列检测、两两比较分析,根据HBV DNA基因序列异源性≥8%定为不同的基因型,而将HBV 分为A、B、C、D四种基因型,从而初步建立了基因分型体系。1994年,Norder等[2]对扩增了的6株HBV DNA测序后又发现了两种新的基因型:E型和F型;2000年,Stuyver等[3]发现了第七种基因型:G型;2002年,Arauz-Ruiz等[4]等通过全基因序列分析又发现了H型HBV。至此,目前已发现的HBV基因型共有A- H 8种。基于乙肝病毒表面抗原亚型的复杂性和HBV基因分型的广泛开展,可能会有新的基因型逐渐被发现。 2. HBV基因分型的方法 目前,可用于HBV基因分型的方法有:(1) 全基因序列测定分析;(2) S基因序列测定分析 ;(3) 聚合酶链反应-限制性片断长度多态性分析(PCR-RFLP); (4) 基因型特异性单克隆抗体的ELISA;(5)基因型特异性线性探针检测法;(6)基因型特异性引物 PCR法(即巢式PCR法);(7)微板核酸分子杂交-ELISA。其中全基因序列测定分析方法为金标准,但繁琐、费时,成本高,难以推广,其他方法相对简单,但也均有一定的缺点。目前比较常用的是:PCR-RFLP法和巢式PCR法。 3. HBV基因型的流行病学分布特点 众多研究表明[3~5],HBV基因型分布呈一定的地理区域性:A型主要分布于北欧、西欧、美国及中;B、C型主要分布于东亚、东南亚;D型分布最广,但以地中海地区、中东、南亚为主;E型主要分布于中非;F型主要分布于美洲;G型发现于美国、法国;H型已在尼加拉瓜、墨西哥、和美国的加利福尼亚等地区发现。在我国,以B型和C型为优势基因型,其中北方以C型为主,南方以B型为主,D型多分布于少数民族地区,如新疆、宁夏、西藏、。A、F型偶有发现,尚未见E、G、H型。目前认为,这种地域性分布反映了HBV感染史中发生的变异特点,是病毒变异后进化的结果。 |
-- 作者:xiaozou -- 发布时间:2006-11-3 21:33:25 -- 继续。。。。。。 4. HBV基因型与病毒变异 (1)点1896变异 nt1896 G→A是前C区最常见的点突变,该变异使前C区第28位核苷酸密码子由色氨酸(TGG)变为终止密码子(TAG),从而使前C区启动的编码停止,HBeAg合成终止,病毒无法表达HBeAg,致使血清中HBeAg呈阴性。A型、F型和少数C型病毒株的nt1858位为C,能与nt1896位的G形成稳定的发夹形的茎袢结构,此结构能阻止nt1896 G→A的碱基突变;而B、D、E和大部分C型的nt1858位为T,不能与nt1896位的G形成稳定的茎袢结构,因而易发生A1896突变[5]。这就部分解释了为什么亚洲东部(以B、C型为主)、南欧(以D型为主)发生突变率高,而北欧和北美(以A型为优势株)较少发生。Sumi等[6]研究表明:在HBeAg(+)患者中,B基因型A1896突变率显著高于C型者。 (2) C基因启动子(CP)变异 CP最常见的变异是nt1762位的A→T和nt1764位的G→A变异,此变异极大地降低了C编码区的转录,可使HBeAg缺失,此两点变异为基本核心启动子(BCP)的热点变异,称为“双变异”。Orito等[7]通过对50例B型或C型的慢性乙肝病人研究,发现BCP区1762/1764双变异在基因型C中发生的频率明显高于B型(58%比16%)。Kao等[8]在研究BCP变异增加患HCC的危险性时也发现C基因型1762/1764变异出现的频率显著高于B型(52%比29%)。香港学者Yuen等[9]研究报道:B基因型多与前C区变异相关而C型与CP变异关系密切,Sumi等 [6]等也报道了相同的结果。 (3)前S区变异 此变异可使部分HBV感染者出现血清HBsAg呈阴性而HBV呈阳性。Huy等[10]研究了12个国家387例HBV DNA(+)病例,结果发现前S区(前S1区和前2区)变异,在B基因型和C基因型中分别为25%和24.5%,比其他基因型多见。 5.HBV基因型与病毒复制、清除 Sanchez-Tapias等[11]通过随访、研究258例HBV感染者的基因型,发现A、D型为西班牙西部的优势株,A型的HBV DNA清除率高于D型和F型,同时,A型的HBsAg清除率也比D型高。Lee等[12]研究了台湾南部265例HBV感染者,发现C型HBV感染者HBeAg阳性率高于B型,香港的Yuen等[9]对343名HBV感染者的研究结果表明:B型HBV感染者HBeAg血清转换平均比C型早9年。Furusyo等[13]研究日本福冈和冲绳地区158例HBV感染者后报道:在观察研究的早期,C型HBeAg阳性率明显高于B型,而B型每年HBeAg的自然清除率高于C型。Nakayoshi等[14]对慢性乙肝患者进行随访,在初始的2年里,13例B型中有8例(61.5%)HBeAg被清除,而在14例C型中只有1例(7.1%)出现,提示B型感染者的血清HBeAg清除率较C型者显著常见且较早发生。 上述这些结果表明:C型HBV的HBeAg阳性率高于B型,而B型HBeAg阴性率高于C型,提示C型HBV复制较活跃,易形成持续病毒血症,不易发生e系统血清转换而B型血清转换发生快,免疫清除HBV较C型早。 总之,不同的基因型可能导致HBV病毒不同的的复制、清除率。 6. HBV基因型与疾病谱、疾病进展的关系 人类感染HBV基因型的不同类型,可能与疾病谱及疾病的进展有一定的相关性。Scanchez-Tapias等[11]在研究HBV基因对西班牙西部慢性乙肝患者的影响时发现:患者感染不同的HBV基因型(A、D、F),会造成不同的长期后果,且在致死性相关肝病中,F型比A、D型更常见。Joh等[15]研究分析发现:在7例暴发性肝炎中,基因型的分配为:A型1例、B型1例、C型4例、D型1例,比较 25例急性自限性乙型肝炎,A型的临床过程比C型者长。Hsia等[16]研究美国和加拿大HCC患者时发现,在17例HBV DNA阳性(HBsAg阴性)的HCC患者中,C型为优势基因型,占11例(64%)。 在以B、C基因型为优势基因型的东亚、东南亚,众多的研究报到也表明:基因型的不同可引起不同的疾病谱和疾病进展。日本学者Imamura等[17]比较了61例急性乙肝(包括45例急性自限性乙肝和16例急性爆发性乙肝)和531例慢性乙肝,发现B基因型在急性肝炎组中的比例明显高于慢性肝炎组(39.3%比11.7%),而急性爆发性者又显著多于急性自限性者(62.5%比31.1%)。这些结果提示B基因型较其他基因型更易导致急性严重的肝损害。Sumi等[6]研究报到:在高度纤维化和HCC两组病人中,感染HBV B型者的平均年龄显著大于C型者,经病理组织切片诊断的慢性肝病的病人中,B型患高度纤维化的比例明显小于C型者。香港学者Chan等[18]通过对146例HBeAg阳性的慢性乙肝病人平均随访32个月,发现6名HCC患者均为HBV C型,在血清HBeAg阳性时期,C型疾病的活动性重于B型。另外,Nakayoshi等[14]通过对35例B型和37例C型慢性乙肝患者随访后对照研究发现,在35例B型中有4例(11.4%)发展成肝硬化而37例C型中有12例(32.4%)发展成肝硬化(且包括2名HCC患者)。多因素分析显示,HBV基因型的不同明显影响肝硬化的形成。在肝硬化的形成过程中,B型较少发生。因此,HBV基因型可影响HBV相关慢性肝病的进展。 7. HBV基因型与抗病毒治疗治疗 (1)干扰素治疗 目前,干扰素是公认的治疗HBV感染的首选药之一。感染不同的基因型对干扰素治疗的应答可能会有所不同,Kao等[19]对58例乙肝患者给予α-2b干扰素治疗24周,如果以治疗后48周血清ALT回复恢复正常、HBeAg清除及HBV DNA转阴作为有效指标,B、C两型的有效率分别为41.%和15%,若以血清ALT恢复正常为有效标准,B、C两型的有效率分别为50%和17%,这说明,对干扰素的应答率B型高于C型。Wai等[20]研究109例HBeAg阳性的慢性乙肝病人,对其中的73例(B型31例,C型42例)应用α-干扰素治疗,结果发现,有12例B型和7例C型产生抗病毒反应,B基因型的应答率高于C型。通过多变量分析,基因型、治疗前ALT水平和HBV DNA水平与干扰素应答之间的关系发现B基因型、治疗前低HBV DNA水平和高ALT水平与干扰素高应答率有关,因而,他们认为,与C基因型相比,B型有较高的干扰素诱导的HBeAg清除率。 (2)拉米夫定治疗 拉米夫定是目前另一种抗HBV感染的首选药,它是一种核苷类似物,具有较强的抑制HBV复制的作用。Kao等[21]对31例HBeAg阳性的慢性乙肝患者使用拉米夫定治疗,B、C型的HBeAg血清转换率分别为23%和11%,耐药发生率分别为15%和22%,这提示,B型对拉米夫定的病毒学应答率高于C型。以色列学者Ben-Ariz等[22]研究报道在因出现拉米夫定抵抗而再发HBV感染的肝移植受体者中,D型HBV感染者比A型者多见。Suzuki等[23]对日本234名慢性HBV感染者使用拉米夫定治疗12个月以上,结果发现B基因型的ALT恢复正常率和HBV-DNA转阴率高于C基因型。目前众多临床研究发现,长期使用拉米夫定可引起HBV耐药或病毒变异,常见的变异为YMDD变异(包括YIDD和YVDD变异)。Zollner等[24]研究了41例(26例A基因型和15例D基因型)出现拉米夫定耐药的乙肝患者的病毒学特点,发现出现YIDD变异者,D型中有67%,A型中有19%,而出现YVDD变异者,A型有81%,D型有33%。提示不同的基因型可能对YMDD变异产生不同的影响。 HBV基因型与抗病毒药物治疗应答率之间的关系可能还需要进一步广泛、深入的研究。 |
-- 作者:12252003 -- 发布时间:2007-1-7 21:22:42 -- 我全部保存下来,晚上好好看 |
-- 作者:凤栖梧桐 -- 发布时间:2007-1-7 23:42:05 -- 感谢你们的努力!! |
-- 作者:诸诸2006 -- 发布时间:2007-2-6 21:21:28 -- 辛苦二位了!学习中。。。。。。 |
-- 作者:在你身上飘 -- 发布时间:2007-4-16 12:19:09 -- 我以前也写过一篇差不多的, |
-- 作者:瓶儿 -- 发布时间:2007-5-2 10:06:01 -- 俺也是c型,郁闷 |
-- 作者:Stankovic -- 发布时间:2007-5-2 11:53:09 -- I have never heard that before, and how can I know my HBV gene type? |